Le firmware 1.5.1 de l'Analogue 3D permet de régler l'overclocking en plein jeu

Selon les notes de version publiées par Analogue, le réglage de l'overclocking (une augmentation de la vitesse du processeur au-delà de sa fréquence d'origine) et l'option « Force Original Hardware » sont désormais accessibles en jeu, avec l'ajout d'une position « Off » pour l'overclocking qui peut se combiner aux autres réglages matériels ; le changement d'overclocking effectué en jeu peut prendre quelques secondes pour s'appliquer, précise Analogue. Le firmware améliore aussi le comportement du cache d'instructions du processeur ainsi que les performances de l'upscaling horizontal et de la sortie progressive, et corrige une régression touchant le recadrage vidéo de certains jeux.

Côté confort, la bibliothèque de jeux gagne des options de personnalisation pour les cartouches non reconnues (titre, développeur, éditeur), de nouveaux réglages par défaut pour l'ensemble du catalogue Nintendo 64, la possibilité de créer une « Memory » directement depuis le menu en jeu, et des options de réinitialisation des configurations matérielles ou d'affichage pour toute la bibliothèque en une fois. Le firmware distingue désormais aussi VRS (Japon) et VRU (États-Unis) dans la bibliothèque.